蛋白代謝組學(xué)就是進(jìn)行蛋白組與代謝組聯(lián)合分析。蛋白質(zhì)組學(xué)通過從整體水平上研究生物體或系統(tǒng)內(nèi)的蛋白質(zhì)組成、活動(dòng)規(guī)律以及蛋白質(zhì)之間的相互作用來揭示各項(xiàng)生命活動(dòng)的分子機(jī)理。代謝組學(xué)通過定性和定量表征不同時(shí)期或生理病理?xiàng)l件下機(jī)體產(chǎn)生的小分子代謝物的變化，挖掘關(guān)鍵代謝產(chǎn)物和代謝通路，探索生物體與細(xì)胞代謝相關(guān)的關(guān)鍵科學(xué)問題。

蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)聯(lián)合分析不是簡(jiǎn)單的將兩者的數(shù)據(jù)匯合，而是進(jìn)行歸一化處理以及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，將代謝層面和蛋白層面結(jié)合起來，尋找重要代謝通路中的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物和蛋白質(zhì)繪制代謝網(wǎng)路通路，同時(shí)結(jié)合通路富集和相關(guān)性等分析，構(gòu)建下游代謝物變化以及代謝酶調(diào)控機(jī)制的分子模型，系統(tǒng)全面地解析生物分子功能和調(diào)控機(jī)制，為后續(xù)進(jìn)行深入實(shí)驗(yàn)與分析提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。